Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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CHD4Q14839 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHD4Q14839 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHD4Q14839 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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