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| NCOA4 | Q13772 | RNF38-201 | ENST00000259605 | 5012 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CNOT2-231 | ENST00000551483 | 4753 nt | TSL 2 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | EPC1-203 | ENST00000375110 | 3909 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.74 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | FKTN-201 | ENST00000223528 | 7364 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.74 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNU6-144P-201 | ENST00000383951 | 107 nt | BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | RNU6-1007P-201 | ENST00000516586 | 107 nt | BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AL354798.1-201 | ENST00000622505 | 329 nt | BASIC | 4.15 | □□□□□ -1.75 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AL159152.1-201 | ENST00000635019 | 2587 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | RNU6-1290P-201 | ENST00000362957 | 109 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | MIR513C-201 | ENST00000401352 | 84 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AC139495.1-202 | ENST00000513164 | 354 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CYCSP30-201 | ENST00000546447 | 172 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC008056.1-201 | ENST00000553322 | 394 nt | TSL 3 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC090877.1-201 | ENST00000561418 | 344 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC127024.3-201 | ENST00000582841 | 460 nt | TSL 3 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AC010332.2-201 | ENST00000613083 | 1904 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | PTAR1-202 | ENST00000377200 | 9876 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | DST-201 | ENST00000244364 | 16742 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | TAX1BP1-213 | ENST00000543117 | 3365 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AGTR1-204 | ENST00000418473 | 2071 nt | TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | NLGN1-206 | ENST00000457714 | 8242 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | USH2A-201 | ENST00000307340 | 18883 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CNGA1-201 | ENST00000358519 | 2627 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | DDX60L-209 | ENST00000511577 | 6781 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MACC1-201 | ENST00000332878 | 2994 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | OSBPL8-202 | ENST00000393249 | 7047 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | NCOA1-203 | ENST00000395856 | 6828 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNU6-818P-201 | ENST00000364837 | 108 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | Y_RNA.337-201 | ENST00000365312 | 102 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR30B-201 | ENST00000384850 | 88 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| NCOA4 | Q13772 | SNORA40-201 | ENST00000388090 | 126 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |