Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
MKRN3Q13064 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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