Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms