Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX49Q9Y6V7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDX49Q9Y6V7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms