Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC61Q9Y6R9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC61Q9Y6R9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms