Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNPO3Q9Y5L0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms