Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms