Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms