Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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TPCN1Q9ULQ1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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TPCN1Q9ULQ1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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TPCN1Q9ULQ1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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TPCN1Q9ULQ1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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TPCN1Q9ULQ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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TPCN1Q9ULQ1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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TPCN1Q9ULQ1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPCN1Q9ULQ1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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