Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH13Q9UKX3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH13Q9UKX3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms