Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP4Q9UKK3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP4Q9UKK3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms