Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP21Q9UK80 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms