Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms