Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGXB4Q9UGU5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms