Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COPG2Q9UBF2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms