Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NLKQ9UBE8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms