Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
REREQ9P2R6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
REREQ9P2R6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms