Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL42Q9P2K6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms