Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP36Q9P275 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms