Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms