Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNRD1Q9P1U0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms