Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCMF1Q9P0J7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms