Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CABP1Q9NZU7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CABP1Q9NZU7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms