Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PODXL2Q9NZ53 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PODXL2Q9NZ53 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms