Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMOD3Q9NYL9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMOD3Q9NYL9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms