Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOR4AQ9NXH8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms