Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RHBDL2Q9NX52 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RHBDL2Q9NX52 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms