Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DNAJC28Q9NX36 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms