Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFGAP3Q9NP61 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms