Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLSPNQ9HAW4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLSPNQ9HAW4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms