Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C11orf49Q9H6J7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C11orf49Q9H6J7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C11orf49Q9H6J7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C11orf49Q9H6J7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C11orf49Q9H6J7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms