Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFAP74Q9C0B2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP74Q9C0B2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms