Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SETD2Q9BYW2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETD2Q9BYW2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms