Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC4A5Q9BY07 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms