Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VN1R3Q9BXE9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms