Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms