Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms