Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AKAP9Q99996 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms