Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TCF12Q99081 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms