Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPS6KC1Q96S38 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms