Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUDCD1Q96RS6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms