Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms