Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARXQ96QS3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms