Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPNS2Q96L46 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPNS2Q96L46 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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