Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL4Q96JN8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NEURL4Q96JN8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL4Q96JN8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL4Q96JN8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms