Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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