Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms