Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C18orf8Q96DM3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf8Q96DM3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms