Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NMD3Q96D46 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms